因为武则天的大力支持，军情院的工作很快走上正轨，一大批精心培养出来的情报人员通过了严格的考核，得以结业成。在结业考核结束后，根据这些人的各自特点，他们最终被派往全国各地，还有一些大唐周边未完全纳入大唐治下的小国、部落，执行他们所要负的特殊使命。随着军情院的正式成立，设立在全国各地，包括各边疆都护府、都督府的分析机构也成立，还有多个驻外机构。
这些分机构只对上一级负责，无论是都护府、都督府及各级州府都无权过问，不过各分支机构的所需及支出却是要朝廷通过地方政府负担的，具体办法差不多是这样：军情院各分级机构的支出从各州府、都护府、都督府准备上交的赋税中按比例扣除。这笔开支不会很小，在刚开始时候，各级地方官对朝廷这样的命令不太好理解，有不少质疑的折子送到长安去，但朝廷给予的回复是：这只是暂行之策，等过段时间，会有进一步完善的政策制定出来，但现在必须要遵照现政策实行，不能有误。
当然这肯定是暂行之策，依陈易的建议，待一切都走上正轨后，军情院每年的支出都需要朝廷另外的拔额，并应该在开始时候算入军费开支中去，在军费开支中以单独的立项来拨付。在这一点上，武则天原本并不是很情愿依陈易的想法而为的，但在陈易一而再，再而三的请求、说明后，最终还是同意了，不过也令相关各部，好生计划，早点制定成章。
各分级机构及驻外机构的设立，至少在陈易眼中，是一件很重大的事。必定极大的方便各种情报的刺探，在征战时候能发挥非常大的作用。服务于军事，这是陈易向武则天提议设立情报侦查机构的初衷，从他提议的命名上也可以看出这一点。不过武则天似乎对外围的各种包括军事、经济在内的情报侦查没太大兴趣，她对陈易的要求是，将主要精力放在对内的侦查上，特别是对一些她认为需要监视他们行踪的朝中高官。武则天的命令。陈易也只能服从，令一些能力一般的人员，负责对内的侦查。
对内的侦查其实也是一件几方得利的事，他也能从其中收获自己所需要的情报，为已所用。
所有侦查到的情报，只要事关比较重大的。都会交到陈易手中，经他过目签名后再做处置，是进一步上报，还是采取处断措施，那些不是很重大的事虽然副手们有权力处断，但也要报告给陈易，并在军情院档案室备案。可以说。所有军情院打探到的情报，陈易都能知道，若是他自己想打探更多，可以要求手下人员将所有送呈的情况都交给他过目。不过那是工作量非常大的事，想清闲点的陈易可没这份雅兴，他只是吩咐几位得他信任的手下，张虔勖、杜孝升、刘敬同等各分工负责，不要遗漏任何有价值的情报线索。有用的情报除了他们自己掌握外，也要酌情告诉他。
在收到一些有价值的情报后，武则天也进一步认可了军情院的价值和作用，想将军情院进一步控制在自己手中。她了知道现在军情院的事是陈易一人说了算，她不希望出现这种情况，因此在正式任命陈易为军情院的最高主官“院正”外，另遣左金吾卫将军丘神勣为副院正。职位只在陈易之下。
丘神勣是谁陈易当然知道，这位在原来历史上“臭名昭著”的酷吏在某一个特定时期是武则天非常倚重的亲信人物，为武则天做了数不胜数的坏事，连李贤被赐死都是此人所为。
丘神勣是标准的官二代。其父是贞观时候的名将丘行恭，著名的“昭际六骏”中唯一的人物就是丘行恭。那是在剿灭王世充战斗中，丘行恭跟随李世民突入敌阵，战斗的结果是李世民坐骑中箭，护卫在李世民身侧的丘行恭下马拔箭，并以己之骑与世民，步行马前，执长刀护卫，并大呼突围。因此战护卫有功，丘行恭深得李世民的信任，一直得以重用。丘神勣是丘行恭的次子，因其父的尊荣，早早得朝廷重用，位居左金吾卫将军多年，掌领宫中禁军也使的他的地位非一般人可比。
只不过陈易与此人接触不多，在丘神勣被武则天派到军情院来后，他才派人详细调查了此人的情况，知道这个人一向以心狠手辣著称，不太讲情面，但能力一般，也马上有了如何应付此人之策。
武则天的这一安排陈易当然知道她的目的是什么，这个女人当然想将这个必不可免完全掌握在自己的手里，想通过几个人的协同和相互监看，避免专权的事发生，这是不可避免的事，对武则天这样的决定也没有什么抗拒的表示。只不过军情院的建设全是他一手操办，各部门所有的人员都是他亲自或者通过几名得力的手下寻访所得，忠诚度都有过考验，丘神勣的到来，短时间内不可能撼动他在军情院的地位，可以说丘神勣即使奉武则天的令来到这里，协助陈易负责事务，他也并没多少实际的权力，甚至他连张虔勖等人也指挥不动，更不要说插手其他事务了，差不多等于获了个闲职。
对于初来军情院受到这样的待遇，丘神勣是没有料到的，他曾去找武则天反应过这情况，希望能掌管实际的事，但武则天告诉他不要着急，一切都需要慢慢来。丘神勣也是知道陈易得武则天信任的程度，即使给他一百个胆，在处理事情上也不敢和陈易相争，更不敢当面与陈易起争执。
陈易也清楚这情况，知道在得武则天宠信程度上丘神勣完全不能和他比，只不过丘神勣表现的比他更忠心、更听话而已，相信武则天也知道，丘神勣比他更容易完全掌握。他也不以为意，只是表面上尊重丘神勣，也不让他插手任何机密之类的事，只让他负责军情院的那些杂事。
丘神勣最终无奈地接受了这样的安排，很委屈地去做那些杂事了，并对陈易故意的刁难很是耿耿于怀。很想采取一些手段报复一下，但在军情院他孤掌难鸣，在正经事上没有理会他的命令，具体的事上他也不懂，最终也只能罢休。