在九叔与其师弟合力救了阿豪后，他并未悔改，反而继续盗墓。而九叔师兄弟两人也因为争夺一单生意而翻脸，在九叔利用茅山术运尸回乡安葬的时候，其师弟偷偷施法让尸体变成了恐怖僵尸。在片中，九叔运尸的情节以“湘西赶尸”的民俗传说为蓝本，深山荒野之中，九叔前面摇铃引路，后面蹦跳着头贴黄纸符的僵尸，情景诡异新奇。

在九叔与其弟子阿星正在施法降服僵尸时，阿豪因为盗墓而导致棺中女尸异变，一直尾随于他。在逃跑时偶遇路上的九叔师徒俩，为了保命阿豪只得跟随九叔。而九叔也需要人手来抬僵尸帮忙，于是一对师徒，一个僵尸，一个女尸，一个盗墓贼，就一起上路了。当然，后面还有一直图谋不轨的九叔师弟。

在送僵尸回乡安葬的途中，众人在酒店发现女尸原来是军阀的姨太太，一阵斗智斗勇之后，大家才安抚完军阀。此时九叔师弟再次施法让僵尸醒来，可惜他学艺不精，操控不住僵尸，导致僵尸大开杀戒。军阀的手下死伤惨重，九叔与其师弟也认识到必须合作才能控制僵尸，于是放下成见联手对敌。最后师兄弟二人各施其法，还是无法控制僵尸，紧急关头军阀带着大炮赶到，一炮把僵尸轰成碎渣。

众人告别军阀，九叔也坦承他姨太太阳寿已尽，二人缘分已无，施法安葬女尸。九叔师弟也认识到自己的错误，茅山术不是用来赚钱的，而是用来造福苍生，泽沛先人。于是师兄弟二人和好，一同发扬茅山派。阿豪拜了九叔为师学习茅山术，虽然他的初衷只是为了有瓦遮头，有饭吃。阿豪与九叔弟子阿星一路走来，同甘共苦共患难，也结成了深厚的情谊，如今更是成了师兄弟。

《僵尸翻身》的故事结束，也有了后面《僵尸先生》的故事。《僵尸先生》开头一幕，带着一串尸体离开的就是九叔师弟，结尾回来施法用僵尸围攻僵尸的也是九叔师弟。而《僵尸先生》里面的女鬼，杨守礼的想法是让女鬼幻化成李赛凤的样子，让阿豪以为他喜欢的是现实中的小凤。而李赛凤也可以一人饰演两角，除了本身饰演的富豪女儿外，还饰演勾引阿豪的女鬼，这样故事更有戏剧性。比如阿豪一直奇怪为什么白天的小凤和晚上的小凤完全不一样，长相一样性格却完全不同，最后才知自己是被鬼迷。

而在《僵尸翻身》中，军阀的姨太太也是李赛凤饰演。女尸没有台词，只有肢体动作戏，一路跟随阿豪，他做什么女尸做什么。比较考验李赛凤的演技，还有她在亚视学的舞蹈功底。而这也是《僵尸先生》中为什么阿豪看到小凤的第一眼时就会爱上她，不是因为小凤长的年轻貌美，而是因为一切都在冥冥中自有定数，二人的缘分早就注定。

可以说，《僵尸翻身》解释了很多《僵尸先生》里面没有交代清楚的事情。而《僵尸先生》结尾，小凤也拜了九叔师弟为师，因为他带着一串僵尸恰好及时赶回救了大家的命，虽然有投机取巧之嫌，而且最后也是用火烧掉僵尸的。但是小凤认为九叔师弟茅山术不比九叔差，最重要的是，九叔已经有了两个弟子，而九叔师弟一个弟子都还没有，于是拜他为师，以免厚此薄彼。

小凤与九叔众人住在了一起，人多更加热闹了。阿豪与阿星为了博的小凤的欢心，各出奇招，闹出一系列趣事。而九叔与其师弟虽然已经和好，但二人也还时不时因为不服对方，施展茅山术来捉弄对方。可惜两人法力平均，大家谁也奈何不了谁。反而搞得三位弟子身心疲惫，时不时闹矛盾。日子就这样在快快乐乐中过去，直到一位道友带着一副棺材经过镇上。

带着棺材来到香港的道友，拜访完九叔与其师弟后离开，谁知……接下来，就是《僵尸》系列电影的第三部《僵尸叔叔》的故事了。